尼希米建造聖城的過程中有幾項是我們在建造教會上可以學習的。首先是禱告，尼希米關心被擄歸回的百姓，一得知他們在猶太地生活艱難，聖城城牆拆毀，城門被火焚燒，他就開始禱告，甚至禁食祈求。（尼1：11；2：4；5：19）我們學習的重點不在於禱告的方式，而是禱告的心。他有真誠禱告的心是源自於他對神的家的關心，當時被擄的百姓已經歸回，並且聖殿已經重建，但百姓仍然沒有安定的生活。他在意猶太地神的民和神的城受到的逼迫和災難，因而在神面前盡心的祈求。
其次，我們可以學習的是明白神的行事，或說體會神的心意，知道自己要怎麼回應神給我們的看見。尼希米在禱告中先求主紀念祂的慈愛和憐憫我們，並求主赦免以色列民，接著求主紀念祂的應許，也就是重新招聚祂的百姓回到神立名的居所。最後求主為他開路，使他能回應所得知猶太的光景。以他當時的景況，人在千里之外，身居皇家高位，怎麼想也想不到猶太人的遭遇他除了禱告還能有什麼行動。雖然有許多的不清楚，但他的禱告並非只有祈求神施恩，更求主讓自己知道怎麼參與。
從他的禱告詞的最後一句：「主啊，求祢側耳聽祢僕人的祈禱，和喜愛敬畏祢名眾僕人的祈禱，使祢僕人現今亨通，在王面前蒙恩。」（尼1：11）告訴我們有許多人也同他一樣禱告，並且他求神使用他現在的身份（他是王的酒政），並賜給他時機。以他的身份若要參與事奉，王的支持與否是關鍵，就好像面對的關閉的門，王是那鑰匙，但神是握住這把鑰匙的神。我們也要一同禱告，以事奉的心和敬畏的心禱告，並且求神讓我們知道以我們現在的身份，我們如何為神所用，也明白那關鍵，就是開門的鑰匙。神握住這把鑰匙，正等我們預備好的心！
面對我們前面的難處，若我們願意關心、禱告、為神所用，神必定為我們開門！